تأسست هذه الإيبارشية بعد نياحة مثلث الرحمات نيافة الأنبا أثناسيوس مطران بنى سويف و البهنسا الذي تنيح في نوفمبر عام2000 حيث انقسمت الايبارشية إلى خمسة ايبارشيات هي:

     2- ايبارشية ببا والفشن وسمسطا

    3- ايبارشية مغاغة والعدوة

    4- ايبارشية بنى مزار والبهنسا .    

    5- ايبارشية مطاى وتوابعها .

وقد صـــدر قرار

 قداسة البابا الانبا شنودة الثالث

رقم 20 /30 بتاريخ 21 /5 /2001 م بتعيين القمــص عـــزرا الأنبا بيشوى , كاهن كنيسة مارمـرقس بالكويت نائباً بابويا للأبيارشية . وقد تم اســــتدعائه من الكويت بعد خدمة مدتها تســــع ســنوات , وتولى المسئولية كنائب بابوى يوم الخمـــــيس بتاريخ 21/ 6 /2001 م

وبعد فترة وجيـــزة من خدمتــــة بالإيبارشـــــية كنائب بابوي قدمت تزكية لقداسة البابا شنودة الثالث لسيامته أسقفا للإيبارشية .  فقبل قداسة البابا التزكية في محاضـرة الأربعاء الأسبوعية بتاريخ 18 / 7 /2001 م , وأعلن أمـام شعــب الإيبارشيـة وبقيـة الحاضـرين المحاضــرة , بأنه تم تحديد سيامته أسقفاً في عيد النيروز 2001م 

وبالفعل تمت سيامته أسقفاً للإيبارشية بتاريخ 9/9/2001م , ومع نيا فته صاحبي النيافة : نيافة الأنبا أثناسيوس , أسقف بنى مزار والبهنسا , ونيافة الأنبا قزمان , أسقف سيناء الشمالية

وفى حفل بهيج فى 2001/10/20 بحضور لفيف من الاباء الاساقفة وكهنة الايبارشية والايبارشيات المجاورة تم تجيلس نيافة الحبر الجليل اسقف على الايبارشية بمقر الكرسى بكنيسة الشهيد العظيم مارجرجس - مغاغة الرب يحفظ لنا حياتة سنين عدة وازمنة سالمة مديدة